在人類快速的發(fā)展下，人類和妖怪之間的平衡被打破。隨著環(huán)境的破壞，妖怪也不得不背井離鄉(xiāng)生活在人類城市。然而妖怪卻沒有屬于自己的法律保障和社會權(quán)力，這是一個人類為妖怪構(gòu)建的反烏托邦！那么妖怪們究竟要如何擺脫這悲慘的命運呢？

原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機(jī)，因為中醫(yī)不容樂觀的就業(yè)情勢，于是打算轉(zhuǎn)行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因為你是張機(jī)（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機(jī)。 為了讓張機(jī)可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥靈親自教導(dǎo)張機(jī)中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機(jī)，同時讓人參【任弦】作為張機(jī)的幫助與監(jiān)督者。

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機(jī)緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經(jīng)的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結(jié)下深厚羈絆。

不婚主義者一旦懷孕，那該怎么辦？閔恩樹是一個不婚主義者，她是最年輕的團(tuán)隊主管，現(xiàn)在秘密戀愛已經(jīng)三年，男朋友是另一部門負(fù)責(zé)人徐之訓(xùn)。徐之訓(xùn)自認(rèn)為二人已到談婚論嫁的程度，因此向恩樹求了婚。意料之外，求婚被恩樹拒絕。沉浸在痛苦中的閔恩樹在歡迎會上醉得一塌糊涂，借著酒勁，沖動之下與送她回家的下屬職員在過了一晚。恩樹恢復(fù)清醒后，身體卻未如她所愿，產(chǎn)生了一些異常，本以為只是單純的胃腸不適，卻被醫(yī)生告知是懷孕。

魔界王子熙，不顧禁忌闖入禁地，喚醒狂暴的遠(yuǎn)古力量，瀕臨爆體而亡。父親以禁術(shù)將力量封印其體內(nèi)，送他重生人間。十八年后，封印解封，魔界氣息驚動神族，他被迫重回早魔界。此時魔界群龍無首，有神秘力量企圖打破人魔結(jié)界、侵占人間。覺醒宿命的熙重奪王權(quán)，在一次次生死較量中，破解陰謀、踏上守護(hù)兩界和平的驚險之路。